A transzláció és a protein szintézis

A transzlációt riboszómák végzik, amelyek riboszomális RNS (rRNS) és fehérjék nagy molekuláris komplexei. A riboszómák RNS-templátokhoz kötődnek, más néven hírvivő RNS-hez (mRNS), és katalizálják egy polipeptid képződését ezen templát alapján. A folyamat során egy töltéssel rendelkező transzfer RNS (tRNS) felismeri az mRNS egy nukleotid triplettjét, amely egy adott aminosavhoz (AA) illeszkedik. Az új AA ezután a riboszómán növekvő polipeptid következő AA-jához kapcsolódik. A transzláció akkor ér véget, amikor az mRNS egy specifikus nukleotidszekvenciáját eléri (egy stop kodon). A riboszóma ezt követően disszociál, és az mRNS és az újonnan szintetizált fehérje felszabadul. Mielőtt a fehérjék funkcionálisak lennének, megfelelő alakra és célállomásra van szükségük. A fehérjék a transzláció során elkezdenek feltekeredni háromdimenziós szerkezetükbe az AA-szekvencia és a helyi kémiai erők és reakciók szerint. Különböző specializált fehérjék (hajtogatási katalizátorok, chaperonok) szintén segítik az újonnan képződött fehérjéket a megfelelő feltekeredésben és a megfelelő célállomások (pl. citoszol, organellumok, extracelluláris mátrix) elérésében fehérjemódosításokon keresztül. A fehérjék transzlációs sebessége a sejt aktuális körülményeihez és a testi igényekhez igazodik, és bizonyos tápanyagok jelenléte vagy hiánya is befolyásolja.

A genetikai kód

Áttekintés

1. táblázat: A genetikai kód jellemzői.
Jellemző Leírás Kivétel
Egyértelműség (genetikai kód)
  • A kodon csak 1 aminosavra jellemző,
Vesszőmentes, átfedés nélküli
  • Az mRNS minden egyes kodonja folyamatosan 5'-ről 3'-ra transzlálódik egy nyitott leolvasási keretben (ORF),
  • A start kodonnal kezdve és a stop kodonnal végződve,
  • A legtöbb vírus,
Redundancia és degeneráció
  • A genetikai kód redundáns, ami azt jelenti, hogy a legtöbb antigént >1 kodon kódolja,
  • Csökkenti a DNS-mutációk okozta károsodás mértékét,
  • A tRNS-wobble (billegés) jelenségének köszönhetően egyes tRNS molekulák több kodont is képesek felismerni. Ez a rugalmasság a kodon harmadik nukleotidja és az antikodon első nukleotidja közötti párosításban nyilvánul meg,
    • A wobble pozíció az antikodon 5' végén található (a kodon 3. pozíciója), amely általában inozint tartalmaz a szokásos nukleotidok helyett,
      • A hipoxantin nem specifikusan párosul uracillal, adeninnel és citozinnal a kodon 3' végén,
      • Az inozin billegő bázispárokat alkot
    • A legtöbb esetben azok a kodonok, amelyek csupán a harmadik pozíciójukban térnek el, ugyanazt az aminosavat vagy tRNS-t kódolják. Ebből kifolyólag a rendkívül specifikus bázispárosításra csak az mRNS-kodon első két pozíciójában van szükség,
  • Metionin (AUG),
  • Triptofán (UGG),
Univerzális
  • Gyakorlatilag minden élőlény ugyanazt a genetikai kódot használja, ami arra utal, hogy ez a kód az evolúció során nem változott,
  • Ennek megfelelően szinte valamennyi organizmus DNS-ből és RNS-ből fordítja le a fehérjék aminosav-szekvenciáit,
  • Mitokondriumok,
  • Mikoplazmák,
  • Néhány élesztőgomba,
  • Archebaktériumok.

tRNS-töltés

Áttekintés

A transzláció folyamata

A transzláció három fázisban történik egy funkcionális riboszómában: Iniciáció, elongáció és termináció. Ehhez mRNS, tRNS és rRNS szükséges.

Riboszóma kötőhelyek

Iniciáció

Elongáció (lánchosszabbítás)

Termináció

Egy felszabadító faktor (release factor) felismeri a stop kodont, leállítja a transzlációt, és hidrolízissel hasítja a peptidil-tRNS kötéseket (ehhez GTP szükséges), ami a fehérje felszabadulásához vezet.

Fehérje feltekeredés és hibás feltekeredés

Fehérje feltekeredés

Fehérje hibás feltekeredés

Poszt-transzlációs módosítás (Post-translational modification, PTM)

Áttekintés

Fehérjeglikoziláció

N-kötésű glikoziláció O-kötésű glikoziláció
2. táblázat: N-kötésű vs. O-kötésű glikoziláció.
Helyszín
  • Az N-kötésű glikoziláció a durva ER-ben kezdődik: Itt történik az oligoszacharidok kapcsolódása az aszparagin aminosav-maradékokhoz,
  • A folyamat a Golgi-készülékben folytatódik: Itt zajlik a "trimming", azaz a szénhidrátlánc további módosítása és érése,
  • Golgi-készülék,
Glikoziláció gyakorisága
  • ∼90%,
  • ∼10%,
Rögzítve
  • N-glikozidos kötések,
  • O-glikozidos kötések,
Érintett aminosavak
  • Aszparagin,
  • Szerin vagy treonin,
Szénhidrát oldalláncok
  • Komplex oligoszacharidok,
  • Kevésbé komplex oligoszacharidok,
Érintett cukormaradékok
  • Glükóz,
  • Mannóz,
  • Fukóz,
  • Galaktóz,
  • N-acetilglükózamin,
  • N-acetilneuraminsav
  • Galaktóz,
  • N-acetilgalaktózamin,
  • N-acetilglükózamin,
  • N-acetilneuraminsav,
Érintett enzimek/molekulák
  • Specifikus glikozil-transzferázok: Oligo-szacharil-transzferáz,
  • Dolichol-foszfát (a membránban),
  • Egyéb enzimek, pl. flipázok,
  • Specifikus glikozil-transzferázok.
A cukor kapcsolódása a fehérjék aszparagin aminosav-maradékához (azaz az N-kötésű glikoziláció) a durva ER-ben kezdődik.
Enzimatikus glikoziláció vs. Nem-enzimatikus glikáció: Fontos, hogy az enzimatikus glikozilációt ne tévesszük össze a nem-enzimatikus glikációval. A glikáció során az aldózok (pl. glükóz) spontán módon kötődnek a fehérjék aminocsoportjaihoz, és befolyásolhatják azok működését. Klasszikus példa erre a HbA1c (glikált hemoglobin), amelynek funkcióját a glikáció nem befolyásolja.

Lipid horgonyok

Reverzibilis kovalens változások

Az enzimatikus reverzibilis fehérjemódosítás megváltoztatja a fehérje térszerkezetét (konformációját), ezáltal lehetővé téve annak aktivitásának szabályozását. Például egy fehérje kölcsönhatásba léphet más fehérjékkel és/vagy szubsztrátként felismerhetővé válhat. A reverzibilis fehérjemódosítás lényegében lehetővé teszi a fehérje "bekapcsolását" vagy "kikapcsolását".

Irreverzibilis kovalens változások

Fehérje trimmelés

Fehérje szortírozás

Fehérje transzport

Egy fehérje tervezett végső rendeltetési helye az N-terminuson található szignál szekvenciájától (amennyiben rendelkezik ilyennel) függ, és ez határozza meg, hogy a transzláció (fehérjeszintézis) szabad riboszómákon vagy a durva ER-hez kötött riboszómákon fejeződik-e be.

3. táblázat: A fehérje transzport áttekintése.
Rendeltetési hely Szignál szekvencia Riboszóma
Citoszol
  • Nem,
  • Szabad riboszómák,
Mitokondriumok, peroxiszómák vagy sejtmagok
  • Igen,
  • Szabad riboszómák,
Sejtmembrán, lizoszómák vagy extracelluláris (szekréciós fehérjék)
  • Igen,
  • Durva ER riboszómák.

A riboszómák transzlokációja a durva ER-en

Áttekintés

Mechanizmus

  1. A fehérjeszintézis (transzláció) a citoszolban lévő szabad riboszómákon indul meg,
  2. Ha egy szignál szekvencia (egy specifikus, 9–12 aminosavból álló aminosav-szekvencia) szintetizálódik, azt egy szignálfelismerő részecske (SRP) (egy citoszolikus ribonukleoprotein) köti meg
  3. Az SRP transzlációs szünetet indukál, és a riboszómát a peptid lánccal (polipeptid-riboszóma komplex) szállítja az ER membránjához,
  4. Az SRP megkönnyíti a riboszóma és a szignálpeptid kötődését az ER membránján található SRP-receptorhoz,
  5. Az SRP és az SRP-receptor egyaránt GTP-hez kötődik, amely GDP-vé hidrolizálódik; az SRP felszabadul, és így képes lesz új szignál szekvenciához kötődni,
  6. A riboszóma átkerül egy transzlokonhoz, amely az ER membránját átszelő fehérjékből álló komplex, fehérjékkel bélelt csatorna. Ekkor a transzlokon csatornája megnyílik. Ezt a transzlokont Sec61 csatornának nevezik,
  7. A transzláció folytatódik, és a fehérje az ER lumenjébe szintetizálódik,
  8. A növekvő fehérjéből a szignál szekvenciát egy szignál peptidáz vágja le,
  9. A transzláció befejezése után a riboszóma felszabadul a citoszolba,
  10. A transzlokon csatornája bezárul, és a szintetizált fehérje az ER-ben marad. A transzláció során a fehérje feltekeredik natív konformációjába.

Ha az SRP hiányzik vagy hibásan működik, a fehérjék felhalmozódnak a sejt citoszoljában!

Fehérjemodifikáció és -eloszlás

Transzlációs szabályozás

Áttekintés